Το ελικοβακτηρίδιο του πυλωρού είναι ένα ανθεκτικό μικρόβιο που επιβιώνει στο εξαιρετικά επιθετικό περιβάλλον του στομάχου. Ενοχοποιείται για γαστρίτιδα (από ήπια έως βαριά), έλκη στομάχου και δωδεκαδακτύλου και σε ορισμένες περιπτώσεις με καρκίνο του στομάχου και λέμφωμα.

Η ελκώδης κολίτιδα και η νόσος του Crohn (γνωστές και ως ιδιοπαθείς φλεγμονώδης νόσοι του εντέρου ή απλώς ΙΦΝΕ) είναι νοσήματα που προκαλούν μια χρόνια και ειδική φλεγμονή μόνο στο παχύ έντερο η πρώτη και σ’ ολόκληρο το πεπτικό σύστημα η δεύτερη.

Με τον όρο Εκκολπώματα εντέρου εννοούμε προβολές του βλεννογόνου (σαν μικρά σακουλάκια) μέσα από τρύπες που δημιουργούνται στους μύες που περιβάλλουν τον πεπτικό σωλήνα.

Ο καρκίνος παχέος εντέρου είναι ένας κακοήθης όγκος που αναπτύσσεται στην εσωτερική επιφάνεια του παχέος εντέρου. Στις ∆υτικές κοινωνίες, αποτελεί τον τρίτο σε συχνότητα καρκίνο για άντρες και γυναίκες και τη δεύτερη σε σειρά αιτία θανάτου από καρκίνο.

Γενικές οδηγίες για τη σωστή διατροφή για ευερέθιστο έντερο προκειμένου να βελτιωθούν τα υποκείμενα ενοχλήματα. Αν και δεν υπάρχει δίαιτα για ευερέθιστο έντερο καθολικά αποτελεσματική με την έννοια του διαιτολογίου, οι παρακάτω οδηγίες προσπαθούν να δώσουν ορισμένες κατευθύνσεις πάνω στις οποίες μπορεί κανείς να δοκιμάσει και να διακρίνει τί ακριβώς προκαλεί ή και ενισχύει τα ενοχλήματά του και επομένως πρέπει να αποφεύγει.

Το σύνδρομο ευερεθίστου εντέρου (ΣΕΕ), γνωστό και σαν «σπαστική κολίτιδα» ή «κολίτιδα» είναι η συχνότερη λειτουργική κλινική διαταραχή του πεπτικού συστήματος. Η καλοήθης αυτή πάθηση, παρότι δεν απειλεί τη ζωή, επηρεάζει την ποιότητα ζωής των ασθενών επιδρώντας στην ικανότητά τους να εργαστούν και να δραστηριοποιηθούν κοινωνικά.